在申请系统集成三四级资质的过程中，首要步骤是申请单位需要准备相关材料。需填写由工信部计算机信息系统集成资质认证工作办公室制定的《计算机信息系统集成资质申报表》，并附上认证机构提供的《计算机信息系统集成资质认证报告》。这些文件需一并提交至申请单位所在地的省市工信部主管部门。
企业取得涉密信息系统集成资质需要经过申请受理、书面审查、现场审查、审批、证书发放等一系列的过程，历时6至8个月。涉密信息系统集成业务种类包括：系统集成、系统咨询、软件开发、综合布线、安防监控、屏蔽室建设、运行维护、数据恢复、工程监理、以及国家保密行政管理部门审查批准的其他业务。
一）申请（意向）受理：拟申请认证组织（以下简称受指导方）提出申请时需提供组织情况简介、营业执照、生产工艺流程图（服务流程、工作流程）等资料。
一）申请单位准备资质申报材料通过认证机构认证的申请单位填写工信部计算机信息系统集成资质认证工作办公室统一制定的《计算机信息系统集成资质申报表》，连同认证机构出具的《计算机信息系统集成资质认证报告》一并提交到申请单位所在省市工信部主管部门。
办理信息系统集成资质最重要的一点是要有项目经理，如：四级资质需要2名中级项目经理，三级资质需要5名项目经理和1名高级项目经理，等等。 如果你具有系统集成项目管理工程师或信息系统项目管理师证书都可以办理项目经理，前者申请为中级项目经理，后者申请为高级项目经理。
根据资质等级区别（一）涉密信息系统集成资质分为甲级和乙级两个等级。甲级资质单位可以从事绝密级、机密级和秘密级信息系统集成业务。乙级资质单位可以从事机密级、秘密级信息系统集成业务。
甲级资质单位享有全国范围内的涉密系统集成业务权限，它们可以处理各种高度敏感的信息。 乙级资质单位则限定在特定区域开展业务，通常仅限于其批准的省、自治区和直辖市内，这类单位处理的涉密项目相对受限。
甲级资质单位可在全国范围内从事涉密系统集成业务。乙级资质单位仅限在所批准的省、自治区、直辖市所辖行政区域内从事涉密系统集成业务。
系统集成资质分为甲级、乙级和单项三种。甲级资质单位可在全国范围内承接涉密信息系统的规划、设计和实施业务。同时，只能提供本单位承建的涉密信息系统的系统服务和系统咨询，不得从事其他单项资质业务。
持有甲级资质的单位具备在全国范围内从事涉密系统集成业务的资格。 乙级资质的单位仅能在所在省级行政区域内从事涉密系统集成业务。 单项资质的单位可以在全国范围内承接指定的涉密系统集成业务，如软件开发、综合布线、系统服务、咨询服务、屏蔽室建设、风险评估、工程监理和数据恢复等。
1、在国内，申请涉密计算机信息系统集成资质的单位应具备特定条件。首先，作为独立法人实体的企业或事业单位，必须严格遵守中国的保密法律法规，并拥有完善的保密管理体系。具备信息产业部颁发的《计算机信息系统集成资质证书》，一级或二级资质是必要条件。同时，要求有网络安全集成的成功案例作为实际能力的证明。
2、涉密系统集成单位应当是中华人民共和国境内具有独立法人地位的企业或事业单位。并具备下列条件：遵守国家保密法律和法规，具有健全的保密制度。具有信息产业部颁发的《计算机信息系统集成资质证书》（一级或二级），并有网络安全集成的成功范例。
3、要申请涉密计算机信息系统集成的甲级资质，首先，公司需要在中华人民共和国境内注册成立，且由中国公民、法人或国家投资的企事业单位投资。公司需有3年及以上的法人资格，无违法记录，并确保所有工作人员为境内的中国公民。此外，企业应具备符合国家保密局规定的安全保密措施和硬件环境。
4、涉密信息系统集成资质分为甲级和乙级，每一级均包括9类单项资质，分别是系统集成、系统咨询、软件开发、综合布线、安防监控、屏蔽室建设、运行维护、数据恢复、工程监理。其中，国家保密局受理甲级资质申请，省国家保密局受理乙级资质申请。
1、申请甲级资质的，应当向国家保密行政管理部门提出申请；申请乙级资质的，应当向注册地的省级保密行政管理部门提出申请。
2、申请单位要求：在中华人民共和国境内注册的法人。 成立时间：申请单位需依法成立3年以上，具备良好的诚信记录。 员工资格：申请单位中从事涉密信息系统集成业务的人员应具有中华人民共和国国籍。 投资要求：申请单位不得有境外投资，除非国家有其他规定。
3、方法如下：根据《涉密信息系统集成资质审查工作规程》第八条 申请单位应当在保密行政管理部门公布的期限内提交申请。 甲级资质申请单位应当向国家保密行政管理部门提交《涉密信息系统集成资质申请书》（以下简称《申请书》）及相关材料。
4、企业取得涉密信息系统集成资质需要经过申请受理、书面审查、现场审查、审批、证书发放等一系列的过程，历时6至8个月。涉密信息系统集成业务种类包括：系统集成、系统咨询、软件开发、综合布线、安防监控、屏蔽室建设、运行维护、数据恢复、工程监理、以及国家保密行政管理部门审查批准的其他业务。
5、三）获证：组织向国家著名认证中心申请认证；认证机构派审核员到受指导方审查，合格后颁发证书。办理期限：从体系建立之日起三个月。涉密资质，全称为涉密系统集成资质。该资质是从事涉及国家秘密的计算机信息系统集成业务的单位需要取得的。涉密资质根据资质等级的不同，主管部门不同。
